Das Pfarrhaus Müswangen befindet sich am Dorfausgang wenn man von Müswangen Richtung Hämikon fährt. Bis im Jahr 2018 war dort nebst der Wohnung des Gemeindeleiter auch das Pfarreisekretariat. Heute ist das ganze Haus privat vermietet. Das Pfarreisekretariat befindet sich seit dem direkt neben der Pfarrkirche in einem gemieteten Raum.